Σύμφωνα, πάντως, με δημοσίευμα της Kommersant, ο Χοντορκόφσκι πιέστηκε από τις μυστικές υπηρεσίες να καταθέσει σχετικό αίτημα.
Ο Πούτιν ανακοίνωσε απροσδόκητα την Πέμπτη ότι ο Μιχαήλ Χοντορκόφκι, ο οποίος επρόκειτο να αποφυλακισθεί τον Αύγουστο 2014, τού υπέβαλε πρόσφατα αίτηση χάριτος , πράγμα που κατά το παρελθόν είχε αρνηθεί να κάνει.
Μετά τη δημοσιοποίηση στις αρχές Δεκεμβρίου πληροφορίων, ότι η ρωσική δικαιοσύνη διεξάγει νέες έρευνες κατά του Μιχαήλ Χοντορκόφσκι, οι οποίες είναι πιθανόν να καταλήξουν σε απαγγελία νέων κατηγοριών και τη διεξαγωγή τρίτης δίκης, μέλη των ρωσικών υπηρεσιών είχαν συνομιλία με τον πρώην ολιγάρχη, αποκάλυψαν μη κατονομαζόμενες πηγές, που επικαλείται η Kommersant.
Τα πρόσωπα αυτά τον πληροφόρησαν ότι η υγεία της μητέρας του επιδεινώνεται και τού μίλησαν για πιθανή νέα ποινική του δίωξη.
«Αυτή η συνομιλία, η οποία πραγματοποιήθηκε χωρίς την παρουσία δικηγόρων, έπεισε τον Μιχαήλ Χοντορκόφκσι να καταθέσει αίτηση χάριτος» σύμφωνα με την εφημερίδα.
Λίγο πριν ανακοινώσει ότι θα χορηγήσει χάρη στον Μιχαήλ Χοντορκόφσκι, ο Βλαντίμιρ Πούτιν είχε αφήσει να εννοηθεί ότι ο φυλακισμένος πρώην μεγιστάνας δεν θα αντιμετωπίσει τρίτη δίκη.
Ο Μιχάηλ Χοντορκόφσκι, ο οποίος εθεωρείτο κάποτε ο πλουσιότερος και ισχυρότερος άνδρας της Ρωσίας, συνελήφθη το 2003 και καταδικάσθηκε το 2005 σε κάθειρξη οκτώ ετών για φορολογικές απάτες.
Η ποινή του μετατράπηκε σε κάθειρξη συνολικά 14 ετών έπειτα από μία δεύτερη δίκη το 2010 για «κλοπή πετρελαίου και ξέπλυμα 23,5 δισ. δολαρίων».
Σύμφωνα με τους υπερασπιστές των ανθρωπίνων δικαιωμάτων και πλήθος ξένων παρατηρητών, ο Μιχαήλ Χοντορκόφσκι είναι θύμα ξεκαθαρίσματος λογαριασμών που ενορχηστρώθηκε από τον Πούτιν.